A través de tomografías tridimensionales, un grupo multidisciplinario de especialistas mexicanos descubrió la subestructura edificada entre los años 550 y 800 d.C. en las entrañas del castillo. Esta tiene un significado simbólico cada una de las fases constructivas, como la renovación de grupos de poder, el deterioro natural de los edificios y que los constructores solo rellenaban y cubrian los templos antiguos.
